MED fichier: Concepts et fonctionnalités de base pour créer et lire un maillage

MED fichier

Concepts et fonctionnalités de base pour créer et lire un maillage

Créer un maillage non structuré

Lire un maillage non structuré

Créer un maillage structuré

Lire un maillage structuré

Créer un maillage avec des familles

Lire un maillage avec des familles

### Créer un maillage non structuré

La routine MEDmeshCr / mmhcre permet de créer un maillage dans un fichier MED. Un maillage est identifié par son nom qui est une chaîne de MED_NAME_SIZE caractères (comme tous les noms d'objets du modèle). Lors de la création du maillage, il est nécessaire de préciser outre son nom, sa dimension, la dimension de l'espace de calcul, son type (structuré ou non structuré), l'unité des pas de temps et mode de tri de ces pas de temps (utile pour les maillages évolutifs), ainsi que le type de repère des coordonnées. Dans un premier temps nous ne travaillerons que sur des maillages non évolutifs.

A minima il est nécessaire de définir pour un tel maillage les coordonnées de ses noeuds, ainsi que la connectivité de ses mailles (cf. Connectivités de référence).

L'écriture des coordonnées des noeuds d'un maillage non structuré se fait par l'intermédiaire de la routine MEDmeshNodeCoordinateWr / mmhcow. Cette routine permet l'écriture d'un tableau de coordonnées selon un pas de temps et/ou un numéro d'itération donnés. Comme pour d'autres routines prenant en paramètre des données multi-composantes, on peut choisir le mode de stockage de ces données en mémoire -i.e. MED_FULL_INTERLACE (les composantes d'une entité apparaissent avant celles de l'entité suivante : X1Y1Z1X2Y2Z2...), ou MED_NO_INTERLACE (les composantes n°i de toutes les entités apparaissent avant les composantes n°i+1 (X1X2....Y1Y2....Z1Z2...).

La routine MEDmeshElementConnectivityWr / mmhcyw permet d'écrire les connectivités d'un type géométrique correspondant à un élément d'un maillage selon un pas de temps et/ou un numéro d'itération donnés. L'écriture s'effectue donc type géométrique par type géométrique pour tous les types d'élements : maille (MED_CELL), face (MED_DESCENDING_FACE) ou arête (MED_DESCENDING_EDGE). Une maille est décrite soit par connectivité nodale (MED_NODAL : liste ordonnée des numéros des noeuds), soit par connectivité descendante (MED_DESCENDING : liste ordonnée des numéros des noeuds, arêtes ou faces selon la dimension de la maille considérée). A noter qu'en connectivité nodale, on ne doit écrire que les mailles, les entités faces et arêtes n'étant utilisées que pour la connectivité descendante. Dans le modèle MED, toutes les entités d'un maillage ont une numérotation globale implicite qui débute à 1. Pour les éléments, la numérotation implicite s'obtient en parcourant l'ensemble des types géométriques selon l'ordre de définition du modèle de données. La règle à appliquer pour définir la taille mémoire "T" nécessaire au stockage de la connectivité d'une entité géométrique est la suivante. Dans le cas de la connectivité nodale, on a "T" = nombre de noeuds. Dans le cas de la connectivité descendante, pour une entité de dimension 3 on a "T" = nombre de faces ; pour une entité de dimension 2, on a "T" = nombre d'arêtes, pour une entité de dimension 1, on a "T" = nombre de noeuds.

Même si on ne définit aucun repérage sur les entités d'un maillage, il est nécessaire de créer la famille de numéro zéro qui ne comporte aucun groupe. Par défaut, toutes les entités du maillage, se rattachent à cette famille. Cette création se fait avec la routine MEDfamilyCr / mfacre.

Le premier exemple suivant permet de créer dans un fichier MED, un maillage non structuré 2D.

/* This file is part of MED.
*
* COPYRIGHT (C) 1999 - 2023 EDF R&D, CEA/DEN
* MED is free software: you can redistribute it and/or modify
* it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published by
* the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
* (at your option) any later version.
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* MED is distributed in the hope that it will be useful,
* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
* GNU Lesser General Public License for more details.
*
* You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/*
* How to create an unstructured mesh
*
* Use case 1 : a 2D unstructured mesh with 15 nodes, 8 triangular cells, 4 triangular cells
*/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include <med_utils.h>
#include <string.h>
int main (int argc, char **argv) {
med_idt fid;
const char meshname[MED_NAME_SIZE+1] = "2D unstructured mesh";
const med_int spacedim = 2;
const med_int meshdim = 2;
/* 12345678901234561234567890123456 */
const char axisname[2*MED_SNAME_SIZE+1] = "x y ";
const char unitname[2*MED_SNAME_SIZE+1] = "cm cm ";
const med_float coordinates[30] = { 2.,1., 7.,1., 12.,1., 17.,1., 22.,1.,
2.,6., 7.,6., 12.,6., 17.,6., 22.,6.,
2.,11., 7.,11., 12.,11., 17.,11., 22.,11.};
const med_int nnodes = 15;
const med_int triaconnectivity[24] = { 1,7,6, 2,7,1, 3,7,2, 8,7,3,
13,7,8, 12,7,13, 11,7,12, 6,7,11 };
const med_int ntria3 = 8;
const med_int quadconnectivity[16] = {3,4,9,8, 4,5,10,9,
15,14,9,10, 13,8,9,14};
const med_int nquad4 = 4;
med_err ret=-1;
/* open MED file */
fid = MEDfileOpen("UsesCase_MEDmesh_1.med",MED_ACC_CREAT);
if (fid < 0) {
MESSAGE("ERROR : file creation ...");
goto ERROR;
}
/* write a comment in the file */
if (MEDfileCommentWr(fid,"A 2D unstructured mesh : 15 nodes, 12 cells") < 0) {
MESSAGE("ERROR : write file description ...");
goto ERROR;
}
/* mesh creation : a 2D unstructured mesh */
if (MEDmeshCr(fid, meshname, spacedim, meshdim, MED_UNSTRUCTURED_MESH,
"A 2D unstructured mesh","",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN, axisname, unitname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : mesh creation ...");
goto ERROR;
}
/* nodes coordinates in a cartesian axis in full interlace mode
(X1,Y1, X2,Y2, X3,Y3, ...) with no iteration and computation step
*/
if (MEDmeshNodeCoordinateWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, 0.0,
MED_FULL_INTERLACE, nnodes, coordinates) < 0) {
MESSAGE("ERROR : nodes coordinates ...");
goto ERROR;
}
/* cells connectiviy is defined in nodal mode with no iteration and computation step */
if (MEDmeshElementConnectivityWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, 0.0, MED_CELL, MED_TRIA3,
MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, ntria3, triaconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : triangular cells connectivity ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshElementConnectivityWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, 0.0, MED_CELL, MED_QUAD4,
MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, nquad4, quadconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : quadrangular cells connectivity ...");
goto ERROR;
}
/* create family 0 : by default, all mesh entities family number is 0 */
if (MEDfamilyCr(fid, meshname,MED_NO_NAME, 0, 0, MED_NO_GROUP) < 0) {
MESSAGE("ERROR : family 0 creation ...");
goto ERROR;
}
ret = 0;
ERROR :
/* close MED file */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("ERROR : close file ...");
return -1;
}
return ret;
}

### Lire un maillage non structuré

Dans MED, l'accès aux objets du modèle stockés dans un fichier se fait via deux approches possibles : accès par le nom ou via un itérateur. Pour ce qui concerne les maillages, la routine MEDmeshInfoByName / mmhmin permet de lire les informations relatives à un maillage dont on connaît le nom. Les informations lues correspondent à celles écrites par la routine MEDmeshCr / mmhcre.

Il est ensuite nécessaire pour chaque type d'entité, de lire le nombre d'éléments présents dans le maillage. Cette lecture se faite avec la routine MEDmeshnEntity / mmhnme.

Une fois les nombres d'entités connus (noeuds, mailles, et éventuellement faces et arêtes), il est nécessaire de lire les coordonnées des noeuds avec la routine MEDmeshNodeCoordinateRd / mmhcor et la connectivité de chacun des types géométriques d'éléments présents dans le fichier avec la routine MEDmeshElementConnectivityRd / mmhcyr.

L'exemple suivant permet la lecture du maillage créé avec le premier cas d'utilisation.

/* This file is part of MED.
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* COPYRIGHT (C) 1999 - 2023 EDF R&D, CEA/DEN
* MED is free software: you can redistribute it and/or modify
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* the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
* (at your option) any later version.
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* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
* GNU Lesser General Public License for more details.
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* You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/*
* Use case 2 : read a 2D unstructured mesh with 15 nodes, 8 triangular cells, 4 triangular cells
*/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include <med_utils.h>
#include <string.h>
int main (int argc, char **argv) {
med_idt fid;
const char meshname[MED_NAME_SIZE+1] = "2D unstructured mesh";
char meshdescription[MED_COMMENT_SIZE+1];
med_int meshdim;
med_int spacedim;
med_sorting_type sortingtype;
med_int nstep;
med_mesh_type meshtype;
med_axis_type axistype;
char axisname[2*MED_SNAME_SIZE+1];
char unitname[2*MED_SNAME_SIZE+1];
char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
med_float *coordinates = NULL;
med_int nnodes = 0;
med_int *triaconnectivity = NULL;
med_int ntria3 = 0;
med_int *quadconnectivity = NULL;
med_int nquad4 = 0;
med_bool coordinatechangement;
med_bool geotransformation;
int i;
int ret = -1;
/* open MED file with READ ONLY access mode */
fid = MEDfileOpen("UsesCase_MEDmesh_1.med",MED_ACC_RDONLY);
if (fid < 0) {
MESSAGE("ERROR : open file in READ ONLY ACCESS mode ...");
goto ERROR;
}
/*
* ... we know that the MED file has only one mesh,
* a real code would check ...
*/
/* read mesh informations : mesh dimension, space dimension ... */
if (MEDmeshInfoByName(fid, meshname, &spacedim, &meshdim, &meshtype, meshdescription,
dtunit, &sortingtype, &nstep, &axistype, axisname, unitname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : mesh info ...");
goto ERROR;
}
/* read how many nodes in the mesh */
if ((nnodes = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_NODE, MED_NO_GEOTYPE,
MED_COORDINATE, MED_NO_CMODE,&coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of nodes ...");
goto ERROR;
}
/*
* ... we know that we only have MED_TRIA3 and MED_QUAD4 in the mesh,
* a real code would check all MED geometry cell types ...
*/
/* read how many triangular cells in the mesh */
if ((ntria3 = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,MED_TRIA3,
MED_CONNECTIVITY, MED_NODAL,&coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of MED_TRIA3 ...");
goto ERROR;
}
/* read how many quadrangular cells in the mesh */
if ((nquad4 = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,MED_QUAD4,
MED_CONNECTIVITY, MED_NODAL, &coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of MED_QUAD4 ...");
goto ERROR;
}
/* read mesh nodes coordinates */
if ((coordinates = (med_float*) malloc(sizeof(med_float)*nnodes*spacedim)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshNodeCoordinateRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_FULL_INTERLACE,
coordinates) < 0) {
MESSAGE("ERROR : nodes coordinates ...");
goto ERROR;
}
/* read cells connectivity in the mesh */
if ((triaconnectivity = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*ntria3*3)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshElementConnectivityRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,
MED_TRIA3, MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, triaconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : MED_TRIA3 connectivity ...");
goto ERROR;
}
if ((quadconnectivity = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*nquad4*4)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshElementConnectivityRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,
MED_QUAD4, MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, quadconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : MED_QUAD4 connectivity ...");
goto ERROR;
}
/*
* ... we know that the family number of nodes and elements is 0, a real code would check ...
*/
ret = 0;
ERROR :
/* memory desallocation */
if (coordinates)
free(coordinates);
if (triaconnectivity)
free(triaconnectivity);
if (quadconnectivity)
free(quadconnectivity);
/* close MED file */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("ERROR : close file");
ret = -1;
}
return ret;
}

Une approche plus générique dans la lecture d'un maillage non structuré est donnée dans l'exemple suivant. La routine MEDnMesh / mmhnmh va lire le nombre de maillage dans le fichier. Il s'agit ensuite d'itérer sur ces maillages. La routine MEDmeshInfo / mmhmii permet de lire les informations relatives à un maillage à partir d'un itérateur. La routine MEDmeshnAxis / mmhnax permet de récupérer la dimension de l'espace de calcul en vue de dimensionner la taille des paramètres utiles à la routine MEDmeshInfo.

Comme dans le cas précédent, il est nécessaire de lire les coordonnées des noeuds et la connectivité des mailles du maille (on se place dans le cas d'une connectivité définie en mode nodal). Les routines MEDmeshnEntity / mmhnme et MEDmeshNodeCoordinateRd / mmhcor permettent respectivement de connaître le nombre de noeuds et lire leurs coordonnées. Pour ce qui concerne la lecture de la connectivité des mailles, l'approche proposée est ici plus générique que précédemment. La routine MEDmeshnEntity / mmhnme est d'abord utilisée pour connaître le nombre de type géométriques de mailles présents dans le maillage. Il s'agit ensuite d'itérer sur ce nombre afin de récupérer à chaque itération : le nom et le type géométrique avec la routine MEDmeshEntityInfo / mmheni, le nombre d'élément avec la routine MEDmeshnEntity / mmhnme et le tableau de connectivité avec la routine MEDmeshElementConnectivityRd / mmhcyr.

/* This file is part of MED.
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* MED is distributed in the hope that it will be useful,
* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
* GNU Lesser General Public License for more details.
*
* You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/*
* Use case 3 : read an unstructured mesh : generic approach
*/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include <med_utils.h>
#include <string.h>
int main (int argc, char **argv) {
med_idt fid;
char meshname[MED_NAME_SIZE+1]="";
char meshdescription[MED_COMMENT_SIZE+1]="";
med_int meshdim=0;
med_int spacedim=0;
med_sorting_type sortingtype;
med_int nstep;
med_mesh_type meshtype;
med_axis_type axistype;
char *axisname="";
char *unitname="";
char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1]="";
med_float *coordinates = NULL;
med_int nnodes = 0;
med_int ngeo = 0;
med_int nelt=0;
med_int *connectivity = NULL;
med_bool coordinatechangement;
med_bool geotransformation;
med_int i, j, it, nmesh;
med_geometry_type geotype;
med_geometry_type *geotypes = MED_GET_CELL_GEOMETRY_TYPE;
char geotypename[MED_NAME_SIZE+1];
int ret=-1;
/* open MED file with READ ONLY access mode */
fid = MEDfileOpen("UsesCase_MEDmesh_1.med",MED_ACC_RDONLY);
if (fid < 0) {
MESSAGE("ERROR : open file in READ ONLY ACCESS mode ...");
goto ERROR;
}
/* read how many mesh in the file */
if ((nmesh = MEDnMesh(fid)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read how many mesh ...");
goto ERROR;
}
for (i=0;i<nmesh;i++) {
/* read computation space dimension */
if ((spacedim = MEDmeshnAxis(fid, i+1)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read computation space dimension ...");
goto ERROR;
}
/* memory allocation */
if ((axisname = (char*) malloc(MED_SNAME_SIZE*spacedim+1)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if ((unitname = (char*) malloc(MED_SNAME_SIZE*spacedim+1)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
/* read mesh informations : meshname, mesh dimension, mesh type ... */
if (MEDmeshInfo(fid, i+1, meshname, &spacedim, &meshdim, &meshtype, meshdescription,
dtunit, &sortingtype, &nstep, &axistype, axisname, unitname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : mesh info ...");
free(axisname); free(unitname);
goto ERROR;
}
free(axisname);
free(unitname);
/* read how many nodes in the mesh */
if ((nnodes = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_NODE, MED_NO_GEOTYPE,
MED_COORDINATE, MED_NO_CMODE,&coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of nodes ...");
goto ERROR;
}
/* read mesh nodes coordinates */
if ((coordinates = (med_float*) malloc(sizeof(med_float)*nnodes*spacedim)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshNodeCoordinateRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_FULL_INTERLACE,
coordinates) < 0) {
MESSAGE("ERROR : nodes coordinates ...");
free(coordinates);
goto ERROR;
}
if (coordinates)
free(coordinates);
/* read number of geometrical types for cells */
if ((ngeo = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,MED_GEO_ALL,
MED_CONNECTIVITY, MED_NODAL,&coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of geo type ...");
ISCRUTE_int(geotype);
goto ERROR;
}
for (it=1; it<=ngeo; it++) {
/* get geometry type */
if (MEDmeshEntityInfo(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,MED_CELL,it,
geotypename,&geotype) < 0) {
MESSAGE("ERROR : get geo type ...");
ISCRUTE(it);
goto ERROR;
}
/* how many cells of type geotype ? */
if ((nelt = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,geotype,
MED_CONNECTIVITY, MED_NODAL,&coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of cell ...");
goto ERROR;
}
/* read cells connectivity in the mesh */
if ((connectivity = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*nelt*(geotype%100))) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshElementConnectivityRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,
geotype, MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, connectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : cell connectivity ...");
ISCRUTE_int(geotype);
free(connectivity);
goto ERROR;
}
/* memory deallocation */
if (connectivity) {
free(connectivity);
connectivity = NULL;
}
}
}
/*
* ... we know that the family number of nodes and elements is 0, a real code would check ...
*/
ret=0;
ERROR:
/* close MED file */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("ERROR : close file");
ret=-1;
}
return ret;
}

### Créer un maillage structuré

La création d'un maillage structuré s'effectue avec la routine MEDmeshCr / mmhcre, en précisant qu'il s'agit d'un maillage de type MED_STRUCTURED_MESH. La géométrie d'un maillage structuré est uniquement définie par ses noeuds. La connectivité entre les noeuds est de type (i,j,k) en 3D, (i,j) en 2D et (i) en 1D. On distingue 3 catégories de maillage structuré : les grilles cartésiennes définies dans un repère de coordonnées cartésien (MED_CARTESIAN_GRID), les grilles définies selon un repère de coordonnées polaire (MED_POLAR_GRID), et les grilles curvilignes (MED_CURVILINEAR_GRID).

Dans un maillage structuré, la connaissance des indices d'un noeud en donne la position relative. Nous adopterons le système d'indexation suivant pour ce type de maillage :

Par convention également, le noeud "origine" d'une grille a pour index (1,1,1) en 3D, (1,1) en 2D et (1) en 1D.

Voici par exemple le résultat obtenu pour une grille "5x3".

Dans un maillage structuré, la numérotation des noeuds et des éléments est implicite. Considérons un maillage structuré 2D dont le premier axe comporte "n" points et le second axe "p" points : le noeud d'index (i,j) a pour numéro (i + (j-1) *n) ; l'élément d'index (i,j) (élément porté par le noeud d'index (i,j)) a pour numéro (i + (j-1) * (n-1).

Si on reporte cette convention de numérotation des noeuds et des éléments sur notre grille "5x3", on obtient :

L'écriture des coordonnées d'un maillage structuré correspondant à une grille MED_CARTESIAN_GRID ou MED_POLAR_GRID ne nécessite que l'écriture des indices de coordonnées selon chacun des axes du repère de coordonnées. La routine MEDmeshGridIndexCoordinateWr / mmhgcw permet l'écriture des indices d'un axe donné. Cette routine doit être appelé pour chaque axe du repère de coordonnées. Pour ce qui concerne une grille MED_CURVILINEAR_GRID, il est nécessaire d'écrire toutes les coordonnées des noeuds au même titre que pour un maillage non structuré avec la routine MEDmeshNodeCoordinateWr / mmhcow.

Il est inutile dans un maillage structuré d'écrire la connectivité des mailles dont la définition est implicite. Cependant ces mailles existent bien. Elles sont de type MED_POINT1 pour un maillage 0D, MED_SEG2 pour un maillage 1D, MED_QUAD4 pour un maillage 2D et MED_HEXA8 pour un maillage 3D. Il est possible d'associer à ces mailles tout comme pour les éléments d'un maillage non structuré, les attributs des entités d'un maillage : un numéro (optionnel), un nom (optionnel) de taille MED_SNAME_SIZE caractères, un numéro de famille. La routine MEDmeshEntityNumberWr / mmhenw permet d'écrire un tableau de numéro pour un type d'entité donné. La routine MEDmeshEntityNameWr / mmheaw permet d'écrire un tableau de noms pour un type d'entité donné. L'écriture des noms et numéros des entités d'un maillage est optionnelle. La routine MEDmeshEntityFamilyNumberWr / mmhfnw permet quant à elle l'écriture des numéros de famille. L'écriture des numéros de famille est optionnelle uniquement lorsque toutes les entités du maillage sont rattachés à la famille 0.

/* This file is part of MED.
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* MED is distributed in the hope that it will be useful,
* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
* GNU Lesser General Public License for more details.
*
* You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/*
* How to create a structured mesh
*
* Use case 4 : write a 2D structured mesh (5x3 cartesian grid)
*/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include <med_utils.h>
#include <string.h>
int main (int argc, char **argv) {
med_idt fid;
const char meshname[MED_NAME_SIZE+1] = "2D structured mesh";
const med_int spacedim = 2;
const med_int meshdim = 2;
const char axisname[2*MED_SNAME_SIZE+1] = "x y ";
const char unitname[2*MED_SNAME_SIZE+1] = "cm cm ";
med_int axis, size ;
const med_float cooXaxis[5] = {1.,2.,3.,4.,5.};
const med_float cooYaxis[3] = {1.,2.,3.};
const med_int nquad4 = 8;
/* 12345678901234561234567890123456123456789012345612345678901234561234567890123456123456789012345612345678901234561234567890123456 */
const char cellsnames[8*MED_SNAME_SIZE+1] = "CELL_1 CELL_2 CELL_3 CELL_4 CELL_5 CELL_6 CELL_7 CELL_8 ";
const char familyname [MED_NAME_SIZE+1] = "CART_GRID_QUAD_FAMILY";
const char groupname [MED_LNAME_SIZE+1] = "CART_GRID_GROUP";
const med_int familynumbers[8] = { -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1, -1 };
int ret=-1;
/* MED file creation */
fid = MEDfileOpen("UsesCase_MEDmesh_4.med",MED_ACC_CREAT);
if (fid < 0) {
MESSAGE("ERROR : file creation ...");
goto ERROR;
}
/* create the structured mesh in the MED file */
if (MEDmeshCr(fid, meshname, spacedim, meshdim, MED_STRUCTURED_MESH,
"A 2D structured mesh","",MED_SORT_DTIT,
MED_CARTESIAN, axisname, unitname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : mesh creation ...");
goto ERROR;
}
/* specify the grid type : MED_CARTESIAN_GRID */
if (MEDmeshGridTypeWr(fid,meshname, MED_CARTESIAN_GRID) < 0) {
MESSAGE("ERROR : write grid type ...");
goto ERROR;
}
/* write axis "X" and "Y" coordinates */
axis = 1;
size = 5;
if (MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,0.0,
axis, size, cooXaxis) < 0) {
MESSAGE("ERROR : write of axis X coordinates ...");
goto ERROR;
}
axis++;
size = 3;
if (MEDmeshGridIndexCoordinateWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,0.0,
axis, size, cooYaxis) < 0) {
MESSAGE("ERROR : write of axis Y coordinates ...");
goto ERROR;
}
/* optionnal : names for nodes or elements */
/* In this case, a name is given to the cells of the mesh */
if (MEDmeshEntityNameWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_CELL, MED_QUAD4, nquad4, cellsnames) < 0) {
MESSAGE("ERROR : cells names ...");
goto ERROR;
}
/* We have to create family 0 : by default, all mesh entities family number is 0 */
if (MEDfamilyCr(fid, meshname, MED_NO_NAME, 0, 0, MED_NO_GROUP) < 0) {
MESSAGE("ERROR : family 0 creation ...");
goto ERROR;
}
/* We decide to create a family for boundary quad4 :
by convention a nodes family number is > 0 and an element family number is < 0 */
if (MEDfamilyCr(fid, meshname,familyname, 1, -1, groupname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : family creation ...");
goto ERROR;
}
/* Then we write family number for quad4 */
if (MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_CELL, MED_QUAD4, nquad4, familynumbers) < 0) {
MESSAGE("ERROR : nodes family numbers ...");
goto ERROR;
}
ret = 0;
ERROR:
/* close MED file */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("ERROR : close file ...");
ret = -1;
}
return ret;
}

### Lire un maillage structuré

Une fois le type de maillage identifié avec la routine MEDmeshInfoByName / mmhmin ou MEDmeshInfo / mmhmii, il est nécessaire de lire à quelle catégorie correspond le maillage structuré via la routine MEDmeshGridTypeRd / mmhgtr. Pour les grilles MED_CARTESIAN_GRID ou MED_POLAR_GRID, il est nécessaire de lire les indices de coordonnées selon chaque axes du repère de coordonnées : la routine MEDmeshnEntity / mmhnme permet de lire le nombre d'indices selon un axe donné, la routine MEDmeshGridIndexCoordinateRd / mmhgcr permet la lecture des indices de coordonnées selon les axes de coordonnées du repère. Pour ce qui concerne une grille MED_CURVILINEAR_GRID, il est nécessaire de lire toutes les coordonnées des noeuds au même titre que pour un maillage non structuré avec la routine MEDmeshNodeCoordinateRd / mmhcor.

L'exemple suivant permet la lecture du maillage structuré créé dans le cas d'utilisation précédent.

/* This file is part of MED.
*
* COPYRIGHT (C) 1999 - 2023 EDF R&D, CEA/DEN
* MED is free software: you can redistribute it and/or modify
* it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published by
* the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
* (at your option) any later version.
*
* MED is distributed in the hope that it will be useful,
* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
* GNU Lesser General Public License for more details.
*
* You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/*
* Mesh Use case 5 : read a 2D structured mesh
* 5x3 cartesian grid
*
*/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include <med_utils.h>
#include <string.h>
int main (int argc, char **argv) {
med_idt fid;
const char meshname[MED_NAME_SIZE+1]="2D structured mesh";
med_int spacedim;
med_int meshdim;
char meshdescription[MED_COMMENT_SIZE+1];
char axisname[2*MED_SNAME_SIZE+1];
char unitname[2*MED_SNAME_SIZE+1];
char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
med_mesh_type meshtype;
med_axis_type axistype;
med_grid_type gridtype;
med_int axis, size ;
med_float *cooXaxis = NULL;
med_float *cooYaxis = NULL;
med_bool coordinatechangement;
med_bool geotransformation;
med_int nstep;
med_sorting_type sortingtype;
int j;
int ret=-1;
int ncell=0;
char *cellsname=NULL;
/* open MED file */
fid = MEDfileOpen("UsesCase_MEDmesh_4.med",MED_ACC_RDONLY);
if (fid < 0) {
MESSAGE("ERROR : open file ...");
goto ERROR;
}
/* read mesh informations : meshname, mesh dimension, space dimension ... */
if (MEDmeshInfoByName(fid, meshname, &spacedim, &meshdim, &meshtype, meshdescription,
dtunit, &sortingtype, &nstep, &axistype, axisname, unitname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : mesh info ...");
goto ERROR;
}
/* read the grid type : MED_CARTESIAN_GRID or MED_CURVILINEAR_GRID */
if (MEDmeshGridTypeRd(fid, meshname, &gridtype) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read grid type ...");
}
/*
* ... we know that the mesh is a cartesian grid,
* a real code would check ...
*/
/* read the axis coordinates (MED_CARTESIAN coordinates system */
/* X */
axis = 1;
if ((size = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_NODE, MED_NONE, MED_COORDINATE_AXIS1, MED_NO_CMODE,
&coordinatechangement, &geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of coordinates on X axis ...");
goto ERROR;
}
ncell = size-1;
if ((cooXaxis = (med_float *) malloc(sizeof(med_float)*size)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshGridIndexCoordinateRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
axis, cooXaxis) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read axis X coordinates ...");
free(cooXaxis);
goto ERROR;
}
free(cooXaxis);
/* Y */
axis = 2;
if ((size = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_NODE, MED_NONE, MED_COORDINATE_AXIS2, MED_NO_CMODE,
&coordinatechangement, &geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of coordinates on Y axis ...");
goto ERROR;
}
ncell = ncell * (size-1);
if ((cooYaxis = (med_float *) malloc(sizeof(med_float)*size)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshGridIndexCoordinateRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
axis, cooYaxis) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read axis Y coordinates ...");
free(cooYaxis);
goto ERROR;
}
free(cooYaxis);
/* read cells name */
cellsname = (char *) malloc((sizeof(char))*ncell*MED_SNAME_SIZE+1);
if (MEDmeshEntityNameRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_CELL, MED_QUAD4, cellsname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read cells name ...");
free(cellsname);
goto ERROR;
}
free(cellsname);
ret=0;
ERROR:
/* close MED file */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("ERROR : close file ...");
ret = -1;
}
return ret;
}

### Créer un maillage avec des familles

Dans MED, les familles constituent une partition de l'ensemble des entités du maillage : chaque entité du maillage (noeud, maille, face ou arête) appartient à une seule famille. Une famille permet de repérer des zones à particulariser pour le calcul : propriétés physiques, conditions aux limites, extraction des résultats, etc. Un objet famille est identifié par son nom (chaîne de MED_NAME_SIZE caractères) et son numéro. Une famille est décrite par une liste de groupes auxquels les entités de la famille appartiennent. Un groupe est identifié par une chaîne de caractères de MED_LNAME_SIZE caractères.

Une famille donnée ne peut porter que sur un seul type d'entité, une famille est donc soit (exclusif) : une famille de noeuds, une famille d'éléments (mailles/faces/arêtes). Dans un maillage MED, on trouve trois types de familles: la famille de numéro 0 qui ne comporte aucun groupe ; zéro ou plusieurs familles de noeuds dont le numéro doit être strictement positif ; zéro ou plusieurs familles d'éléments (mailles/faces/arêtes) dont le numéro doit être strictement négatif.

La définition de la famille vide de numéro 0 est obligatoire, elle constitue la famille de référence pour tous les noeuds et les éléments qui n'appartiennent à aucun groupe. Une famille de noeuds peut porter le même nom qu'un famille d'éléments. Par contre les familles d'éléments (respectivement de noeuds) doivent toutes avoir des noms différents. La création d'une famille dans un maillage se fait à l'aide de la routine MEDfamilyCr / mfacre.

Le numéro de famille est le lien existant entre la famille considérée et une entité du maillage (noeud, maille, face ou arête). Ce numéro doit être unique dans chaque maillage. La routine MEDmeshEntityFamilyNumberWr / mmhfnw permet l'écriture des numéros de famille pour un type d'entité donné.

Le cas d'utilisation suivant créé dans un maillage non structuré 2D, une famille associée aux noeuds situés sur le bord du maillage. Cette famille porte le numéro 1 et tous les noeuds situés au bord sont rattachés à cette famille. Les numéro de famille des autres noeuds reste à 0.

/* This file is part of MED.
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* COPYRIGHT (C) 1999 - 2023 EDF R&D, CEA/DEN
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* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
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* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/*
* How to create an unstructured mesh
*
* Use case 10 : a 2D unstructured mesh with 15 nodes, 8 triangular cells, 4 triangular cells
* and families
*/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include <med_utils.h>
#include <string.h>
int main (int argc, char **argv) {
med_idt fid;
const char meshname[MED_NAME_SIZE+1] = "2D unstructured mesh";
const med_int spacedim = 2;
const med_int meshdim = 2;
const char axisname[2*MED_SNAME_SIZE+1] = "x y ";
const char unitname[2*MED_SNAME_SIZE+1] = "cm cm ";
const med_float coordinates[30] = { 2.,1., 7.,1., 12.,1., 17.,1., 22.,1.,
2.,6., 7.,6., 12.,6., 17.,6., 22.,6.,
2.,11., 7.,11., 12.,11., 17.,11., 22.,11.};
const med_int nnodes = 15;
const med_int triaconnectivity[24] = { 1,7,6, 2,7,1, 3,7,2, 8,7,3,
13,7,8, 12,7,13, 11,7,12, 6,7,11 };
const med_int ntria3 = 8;
const med_int quadconnectivity[16] = {3,4,9,8, 4,5,10,9,
15,14,9,10, 13,8,9,14};
const med_int nquad4 = 4;
const char familyname[MED_NAME_SIZE+1] = "BOUNDARY_VERTICES";
const char groupname[MED_LNAME_SIZE+1] = "MESH_BOUNDARY_VERTICES";
const med_int familynumbers[15] = { 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1 };
int ret=-1;
/* open MED file */
fid = MEDfileOpen("UsesCase_MEDmesh_10.med",MED_ACC_CREAT);
if (fid < 0) {
MESSAGE("ERROR : file creation ...");
goto ERROR;
}
/* write a comment in the file */
if (MEDfileCommentWr(fid,"A 2D unstructured mesh : 15 nodes, 12 cells") < 0) {
MESSAGE("ERROR : write file description ...");
goto ERROR;
}
/* mesh creation : a 2D unstructured mesh */
if (MEDmeshCr(fid, meshname, spacedim, meshdim, MED_UNSTRUCTURED_MESH,
"A 2D unstructured mesh","",MED_SORT_DTIT,MED_CARTESIAN, axisname, unitname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : mesh creation ...");
goto ERROR;
}
/* nodes coordinates in a cartesian axis in full interlace mode
(X1,Y1, X2,Y2, X3,Y3, ...) with no iteration and computation step
*/
if (MEDmeshNodeCoordinateWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, 0.0,
MED_FULL_INTERLACE, nnodes, coordinates) < 0) {
MESSAGE("ERROR : nodes coordinates ...");
goto ERROR;
}
/* cells connectiviy is defined in nodal mode */
if (MEDmeshElementConnectivityWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, 0.0, MED_CELL, MED_TRIA3,
MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, ntria3, triaconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : triangular cells connectivity ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshElementConnectivityWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, 0.0, MED_CELL, MED_QUAD4,
MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, nquad4, quadconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : quadrangular cells connectivity ...");
goto ERROR;
}
/* create family 0 : by default, all mesh entities family number is 0 */
if (MEDfamilyCr(fid, meshname,MED_NO_NAME, 0, 0, MED_NO_GROUP) < 0) {
MESSAGE("ERROR : family creation ...");
goto ERROR;
}
/* create a family for boundary vertices : by convention a nodes family number is > 0,
and an element family number is < 0 */
if (MEDfamilyCr(fid, meshname,familyname, 1, 1, groupname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : family creation ...");
goto ERROR;
}
/* write family number for nodes */
if (MEDmeshEntityFamilyNumberWr(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_NODE, MED_NONE, nnodes, familynumbers) < 0) {
MESSAGE("ERROR : nodes family numbers ...");
goto ERROR;
}
ret=0;
ERROR:
/* close MED file */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("ERROR : close file ...");
ret=-1;
}
return ret;
}

### Lire un maillage avec des familles

Pour lire un maillage MED de façon générique, il est nécessaire de lire les familles qui outre la famille 0, existent potentiellement dans le maillage. De plus pour chaque type d'entité présent dans le maillage, il est nécessaire de lire le numéro de famille.

La routine MEDnFamily / mfanfa lit le nombre de famille dans un maillage. Il s'agit ensuite d'itérer sur chacune de ces familles. A chaque itération, la routine MEDnFamilyGroup / mfanfg permet de lire le nombre de groupe d'une famille et la routine MEDfamilyInfo / mfafai permet de récupérer les informations relatives à une famille : nom, numéro, liste des groupes. A noter qu'il est également possible d'utiliser la routine MEDfamily23Info / mfaofi pour lire les informations relatives aux familles des fichiers MED 2.3 qui en plus des groupes pouvaient comporter une liste d'attributs entiers (notion devenue obsolète dans MED 3.0), le nombre d'attribut d'une famille pouvant être récupéré avec la routine MEDnFamily23Attribute / mfaona.

Il est possible de lire les numéros de famille pour chaque type d'entité du maillage avec la routine MEDmeshEntityFamilyNumberRd / mmhfnr. Si le tableau de numéro n'est pas présent, cela indique que toutes les entités concernées portent le numéro de famille 0.

Le cas d'utilisation suivant offre un exemple de lecture des familles d'un maillage.

/* This file is part of MED.
*
* COPYRIGHT (C) 1999 - 2023 EDF R&D, CEA/DEN
* MED is free software: you can redistribute it and/or modify
* it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published by
* the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
* (at your option) any later version.
*
* MED is distributed in the hope that it will be useful,
* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
* GNU Lesser General Public License for more details.
*
* You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/*
* Use case 11 : read a 2D unstructured mesh with 15 nodes, 8 triangular cells, 4 quadragular cells with
* nodes families
*/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include <med_utils.h>
#include <string.h>
int main (int argc, char **argv) {
med_idt fid;
const char meshname[MED_NAME_SIZE+1] = "2D unstructured mesh";
char meshdescription[MED_COMMENT_SIZE+1]="";
med_int meshdim;
med_int spacedim;
med_sorting_type sortingtype;
med_int nstep;
med_mesh_type meshtype;
med_axis_type axistype;
char axisname[2*MED_SNAME_SIZE+1]="";
char unitname[2*MED_SNAME_SIZE+1]="";
char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1];
med_float *coordinates = NULL;
med_int nnodes = 0;
med_int *triaconnectivity = NULL;
med_int ntria3 = 0;
med_int *quadconnectivity = NULL;
med_int nquad4 = 0;
med_bool coordinatechangement;
med_bool geotransformation;
int i;
med_int nfamily, ngroup;
med_int familynumber;
char *groupname=NULL;
char familyname[MED_NAME_SIZE+1]="";
med_int *familynumbers = NULL;
med_int nfamilynumber = 0;
int ret=-1;
/* open MED file with READ ONLY access mode */
fid = MEDfileOpen("UsesCase_MEDmesh_10.med",MED_ACC_RDONLY);
if (fid < 0) {
MESSAGE("ERROR : open file in READ ONLY ACCESS mode ...");
goto ERROR;
}
/*
* ... we know that the MED file has only one mesh,
* a real code would check ...
*/
/* read mesh informations : mesh dimension, space dimension ... */
if (MEDmeshInfoByName(fid, meshname, &spacedim, &meshdim, &meshtype, meshdescription,
dtunit, &sortingtype, &nstep, &axistype, axisname, unitname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : mesh info ...");
goto ERROR;
}
/* read how many nodes in the mesh */
if ((nnodes = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_NODE, MED_NO_GEOTYPE,
MED_COORDINATE, MED_NO_CMODE,&coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of nodes ...");
goto ERROR;
}
/*
* ... we know that we only have MED_TRIA3 and MED_QUAD4 in the mesh,
* a real code would check all MED geometry cell types ...
*/
/* read how many triangular cells in the mesh */
if ((ntria3 = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,MED_TRIA3,
MED_CONNECTIVITY, MED_NODAL,&coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of MED_TRIA3 ...");
goto ERROR;
}
/* read how many quadrangular cells in the mesh */
if ((nquad4 = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,MED_QUAD4,
MED_CONNECTIVITY, MED_NODAL, &coordinatechangement,
&geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : number of MED_QUAD4 ...");
goto ERROR;
}
/* read mesh nodes coordinates */
if ((coordinates = (med_float*) malloc(sizeof(med_float)*nnodes*spacedim)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshNodeCoordinateRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_FULL_INTERLACE,
coordinates) < 0) {
MESSAGE("ERROR : nodes coordinates ...");
free(coordinates);
goto ERROR;
}
free(coordinates);
/* read cells connectivity in the mesh */
if ((triaconnectivity = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*ntria3*3)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshElementConnectivityRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,
MED_TRIA3, MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, triaconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : MED_TRIA3 connectivity ...");
free(triaconnectivity);
goto ERROR;
}
free(triaconnectivity);
if ((quadconnectivity = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*nquad4*4)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDmeshElementConnectivityRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT, MED_CELL,
MED_QUAD4, MED_NODAL, MED_FULL_INTERLACE, quadconnectivity) < 0) {
MESSAGE("ERROR : MED_QUAD4 connectivity ...");
free(quadconnectivity);
goto ERROR;
}
free(quadconnectivity);
/*
* read families of entities...
*/
if ((nfamily = MEDnFamily(fid,meshname)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read number of family ...");
goto ERROR;
}
for (i=0; i<nfamily ; i++) {
if ((ngroup = MEDnFamilyGroup(fid, meshname, i+1)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read number of group in a family ...");
goto ERROR;
}
if (ngroup > 0) {
if ((groupname = (char*) malloc(sizeof(char)*MED_LNAME_SIZE*ngroup+1)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (MEDfamilyInfo(fid, meshname, i+1, familyname, &familynumber, groupname) < 0) {
MESSAGE("ERROR : family info ...");
free(groupname);
goto ERROR;
}
free(groupname);
}
}
/* check for family numbers */
/* By convention, if there is no numbers in the file, it means that 0 is the family
number of all nodes */
if ((nfamilynumber = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_NODE, MED_NONE, MED_FAMILY_NUMBER, MED_NO_CMODE,
&coordinatechangement, &geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : check family numbers nodes ...");
goto ERROR;
}
if ((familynumbers = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*nnodes)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (nfamilynumber > 0) {
/* read family numbers for nodes */
if (MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_NODE, MED_NONE, familynumbers) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read family numbers nodes ...");
goto ERROR;
}
} else
for (i=0; i<nnodes; i++) *(familynumbers+i) = 0;
for (i=0; i<nnodes; i++) {
printf(IFORMAT, *(familynumbers+i));
if (i+1 != nnodes)
printf(" - ");
else
printf("\n");
}
if (familynumbers)
free(familynumbers);
/* read family numbers for cells */
if ((nfamilynumber = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_CELL, MED_TRIA3, MED_FAMILY_NUMBER, MED_NODAL,
&coordinatechangement, &geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : check family number tria3 ...")
goto ERROR;
}
if ((familynumbers = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*ntria3)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (nfamilynumber > 0) {
if (MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_CELL, MED_TRIA3, familynumbers) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read family numbers tria3 ...");
}
} else
for (i=0; i<ntria3; i++) *(familynumbers+i) = 0;
free (familynumbers);
if ((nfamilynumber = MEDmeshnEntity(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_CELL, MED_QUAD4, MED_FAMILY_NUMBER, MED_NODAL,
&coordinatechangement, &geotransformation)) < 0) {
MESSAGE("ERROR : check family number quad4 ...");
goto ERROR;
}
if ((familynumbers = (med_int *) malloc(sizeof(med_int)*nquad4)) == NULL) {
MESSAGE("ERROR : memory allocation ...");
goto ERROR;
}
if (nfamilynumber > 0) {
if (MEDmeshEntityFamilyNumberRd(fid, meshname, MED_NO_DT, MED_NO_IT,
MED_CELL, MED_QUAD4, familynumbers) < 0) {
MESSAGE("ERROR : read family numbers quad4 ...");
goto ERROR;
}
} else
for (i=0; i<nquad4; i++) *(familynumbers+i) = 0;
free (familynumbers);
ret=0;
ERROR:
/* close MED file */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("ERROR : close file");
ret= -1;
}
return ret;
}

L'exemple suivant propose une approche similaire avec les routines permettant la lecture des fichiers MED 2.3.

/* This file is part of MED.
*
* COPYRIGHT (C) 1999 - 2023 EDF R&D, CEA/DEN
* MED is free software: you can redistribute it and/or modify
* it under the terms of the GNU Lesser General Public License as published by
* the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
* (at your option) any later version.
*
* MED is distributed in the hope that it will be useful,
* but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
* MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
* GNU Lesser General Public License for more details.
*
* You should have received a copy of the GNU Lesser General Public License
* along with MED. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
*/
/******************************************************************************
* - Nom du fichier : test9.c
*
* - Description : lecture des familles d'un maillage MED
*
*****************************************************************************/
#include <med.h>
#define MESGERR 1
#include "med_utils.h"
#include <string.h>
#ifdef DEF_LECT_ECR
#define MODE_ACCES MED_ACC_RDWR
#elif DEF_LECT_AJOUT
#define MODE_ACCES MED_ACC_RDEXT
#else
#define MODE_ACCES MED_ACC_CREAT
#endif
int main (int argc, char **argv)
{
med_err ret = 0;
med_idt fid;
char maa[MED_NAME_SIZE+1];
med_int mdim;
med_int nfam;
int i,j;
med_int natt,ngro;
char *attdes,*gro;
med_int *attval,*attide;
char nomfam[MED_NAME_SIZE+1];
med_int numfam=0, nstep=0, sdim=0;
char str1[MED_COMMENT_SIZE+1];
char str2[MED_LNAME_SIZE+1];
char desc[MED_COMMENT_SIZE+1];
char dtunit[MED_SNAME_SIZE+1]="";
char nomcoo[2*MED_SNAME_SIZE+1]="";
char unicoo[2*MED_SNAME_SIZE+1]="";
med_mesh_type type;
med_sorting_type sort;
med_axis_type rep;
/* Ouverture du fichier "test8.med" en lecture seule */
if ((fid = MEDfileOpen("test8.med",MED_ACC_RDONLY)) < 0) {
MESSAGE("Erreur a l'ouverture du fichier test8.med");
return -1;
}
if ((sdim=MEDmeshnAxis(fid, 1)) <0) {
MESSAGE("Erreur a la lecture de la dimension de l'espace du maillage :");
SSCRUTE(maa);
return -1;
}
/* Lecture des infos concernant le premier maillage */
if ( MEDmeshInfo( fid, 1, maa, &sdim, &mdim, &type, desc, dtunit, &sort,
&nstep, &rep, nomcoo,unicoo) < 0 ) {
MESSAGE("Erreur a la lecture des informations sur le maillage : ");SSCRUTE(maa);
return -1;
} else {
printf("Maillage de nom : |%s| , de dimension : "IFORMAT" , et de type %d\n",maa,mdim,type);
printf("\t -Dimension de l'espace : "IFORMAT"\n",sdim);
printf("\t -Description du maillage : %s\n",desc);
printf("\t -Noms des axes : |%s|\n",nomcoo);
printf("\t -Unités des axes : |%s|\n",unicoo);
printf("\t -Type de repère : %d\n",rep);
printf("\t -Nombre d'étape de calcul : "IFORMAT"\n",nstep);
printf("\t -Unité des dates : |%s|\n",dtunit);
}
/* Lecture du nombre de familles */
if ((nfam = MEDnFamily(fid,maa)) < 0) {
MESSAGE("Erreur a la lecture du nombre de famille");
return -1;
}
printf("Nombre de familles : "IFORMAT" \n",nfam);
/* Lecture de chaque famille */
for (i=0;i<nfam;i++) {
/* Lecture du nombre de groupe */
if ((ngro = MEDnFamilyGroup(fid,maa,i+1)) < 0) {
MESSAGE("Erreur a la lecture du nombre de groupe de la famille d'indice : ");
ISCRUTE_int(i+1);
ret = -1;
}
/* Lecture du nombre d'attribut */
if ((natt = MEDnFamily23Attribute(fid,maa,i+1)) < 0) {
MESSAGE("Erreur a la lecture du nombre d'attribut de la famille d'indice : ");
ISCRUTE_int(i+1);
ret = -1;
}
if (ret == 0)
printf("Famille %d a "IFORMAT" attributs et "IFORMAT" groupes \n",i+1,natt,ngro);
/* Lecture des informations sur la famille */
if (ret == 0) {
/* Allocations memoire */
attide = (med_int*) malloc(sizeof(med_int)*natt);
attval = (med_int*) malloc(sizeof(med_int)*natt);
attdes = (char *) malloc(MED_COMMENT_SIZE*natt+1);
gro = (char*) malloc(MED_LNAME_SIZE*ngro+1);
if (MEDfamily23Info(fid,maa,i+1,nomfam,attide,attval,attdes,&numfam,gro) < 0) {
MESSAGE("Erreur a la lecture des informations de la famille d'indice : ");
ISCRUTE_int(i+1);
ret = -1;
}
if (ret == 0) {
printf("Famille de nom %s et de numero "IFORMAT" : \n",nomfam,numfam);
printf("Attributs : \n");
for (j=0;j<natt;j++) {
strncpy(str1,attdes+j*MED_COMMENT_SIZE,MED_COMMENT_SIZE);
str1[MED_COMMENT_SIZE] = '\0';
printf("ide = "IFORMAT" - val = "IFORMAT" - des = %s\n",*(attide+j),
*(attval+j),str1);
}
free(attide);
free(attval);
free(attdes);
for (j=0;j<ngro;j++) {
strncpy(str2,gro+j*MED_LNAME_SIZE,MED_LNAME_SIZE);
str2[MED_LNAME_SIZE] = '\0';
printf("gro = %s\n",str2);
}
free(gro);
}
}
}
/* Fermeture du fichier */
if (MEDfileClose(fid) < 0) {
MESSAGE("Erreur a la fermeture du fichier");
return -1;
}
return ret;
}

MED_NO_GROUP
#define MED_NO_GROUP
Definition: med.h:291
MED_TRIA3
#define MED_TRIA3
Definition: med.h:205
MED_ACC_RDONLY
Definition: med.h:122
MED_COMMENT_SIZE
#define MED_COMMENT_SIZE
Definition: med.h:81
med_grid_type
med_grid_type
Definition: med.h:139
MED_UNSTRUCTURED_MESH
Definition: med.h:133
med_geometry_type
int med_geometry_type
Definition: med.h:196
MED_COORDINATE_AXIS1
Definition: med.h:152
MED_SNAME_SIZE
#define MED_SNAME_SIZE
Definition: med.h:84
ISCRUTE_int
#define ISCRUTE_int(entier)
Definition: med_utils.h:314
MEDnMesh
MEDC_EXPORT med_int MEDnMesh(const med_idt fid)
Cette routine permet de lire le nombre de maillages dans un fichier.
Definition: MEDnMesh.c:34
med_idt
hid_t med_idt
Definition: med.h:333
MED_NO_GEOTYPE
#define MED_NO_GEOTYPE
Definition: med.h:234
MEDmeshEntityInfo
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshEntityInfo(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_entity_type entitype, const int geotypeit, char *const geotypename, med_geometry_type *const geotype)
Cette routine indique de façon itérative les types géométriques disponibles dans un maillage.
Definition: MEDmeshEntityInfo.c:41
MEDmeshGridIndexCoordinateRd
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshGridIndexCoordinateRd(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_int axis, med_float *const gridindex)
Cette routine permet la lecture des coordonnées des noeuds d'un maillage structuré selon un axe du re...
Definition: MEDmeshGridIndexCoordinateRd.c:39
MEDfamily23Info
MEDC_EXPORT med_err MEDfamily23Info(const med_idt fid, const char *const meshname, const int famit, char *const familyname, med_int *const attributenumber, med_int *const attributevalue, char *const attributedes, med_int *const familynumber, char *const groupname)
Cette routine permet de lire les informations relatives à une famille d'un maillage créé avec MED 2....
Definition: MEDfamily23Info.c:42
med_err
herr_t med_err
Definition: med.h:334
MEDmeshEntityNameRd
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshEntityNameRd(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_entity_type entitype, const med_geometry_type geotype, char *const name)
Cette routine permet de lire les noms d'un type d'entité d'un maillage.
Definition: MEDmeshEntityNameRd.c:38
med_sorting_type
med_sorting_type
Definition: med.h:311
MED_FAMILY_NUMBER
Definition: med.h:151
MEDmeshInfo
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshInfo(const med_idt fid, const int meshit, char *const meshname, med_int *const spacedim, med_int *const meshdim, med_mesh_type *const meshtype, char *const description, char *const dtunit, med_sorting_type *const sortingtype, med_int *const nstep, med_axis_type *const axistype, char *const axisname, char *const axisunit)
Cette routine permet de lire les informations relatives à un maillage dans un fichier.
Definition: MEDmeshInfo.c:43
MED_STRUCTURED_MESH
Definition: med.h:133
MESSAGE
#define MESSAGE(chaine)
Definition: med_utils.h:324
MED_FULL_INTERLACE
Definition: med.h:98
MEDmeshInfoByName
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshInfoByName(const med_idt fid, const char *const meshname, med_int *const spacedim, med_int *const meshdim, med_mesh_type *const meshtype, char *const description, char *const dtunit, med_sorting_type *const sortingtype, med_int *const nstep, med_axis_type *const axistype, char *const axisname, char *const axisunit)
Cette routine permet de lire les informations relatives à un maillage en précisant son nom.
Definition: MEDmeshInfoByName.c:42
med_int
int med_int
Definition: med.h:344
MED_GET_CELL_GEOMETRY_TYPE
med_geometry_type MED_GET_CELL_GEOMETRY_TYPE[MED_N_CELL_FIXED_GEO+2]
Definition: MEDiterators.c:55
MED_SORT_DTIT
Definition: med.h:311
MEDmeshEntityFamilyNumberWr
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshEntityFamilyNumberWr(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_entity_type entitype, const med_geometry_type geotype, const med_int nentity, const med_int *const number)
Cette routine permet l'écriture des numéros de famille d'un type d'entité d'un maillage.
Definition: MEDmeshEntityFamilyNumberWr.c:39
ISCRUTE
#define ISCRUTE(entier)
Definition: med_utils.h:313
med_bool
med_bool
Definition: med.h:262
MED_COORDINATE_AXIS2
Definition: med.h:152
MEDmeshnEntity
MEDC_EXPORT med_int MEDmeshnEntity(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_entity_type entitype, const med_geometry_type geotype, const med_data_type datatype, const med_connectivity_mode cmode, med_bool *const changement, med_bool *const transformation)
Cette routine permet de lire le nombre d'entités dans un maillage pour une étape de calcul donnée.
Definition: MEDmeshnEntity.c:44
med_float
double med_float
Definition: med.h:338
MED_COORDINATE
Definition: med.h:151
MED_NO_CMODE
Definition: med.h:257
MED_GEO_ALL
#define MED_GEO_ALL
Definition: med.h:238
IFORMAT
#define IFORMAT
Definition: med_utils.h:145
MED_NO_DT
#define MED_NO_DT
Definition: med.h:322
MED_NONE
#define MED_NONE
Definition: med.h:233
MEDmeshElementConnectivityWr
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshElementConnectivityWr(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_float dt, const med_entity_type entitype, const med_geometry_type geotype, const med_connectivity_mode cmode, const med_switch_mode switchmode, const med_int nentity, const med_int *const connectivity)
Cette routine permet d'écrire dans un maillage le tableau des connectivités pour un type géométrique ...
Definition: MEDmeshElementConnectivityWr.c:42
MEDmeshGridIndexCoordinateWr
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshGridIndexCoordinateWr(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_float dt, const med_int axis, const med_int indexsize, const med_float *const gridindex)
Cette routine permet l'écriture des coordonnées des noeuds d'un maillage structuré selon un axe du re...
Definition: MEDmeshGridIndexCoordinateWr.c:43
MEDfileClose
MEDC_EXPORT med_err MEDfileClose(med_idt fid)
Fermeture d'un fichier MED.
Definition: MEDfileClose.c:30
MEDfamilyInfo
MEDC_EXPORT med_err MEDfamilyInfo(const med_idt fid, const char *const meshname, const int famit, char *const familyname, med_int *const familynumber, char *const groupname)
Cette routine permet de lire les informations relatives à une famille d'un maillage.
Definition: MEDfamilyInfo.c:39
MEDnFamily23Attribute
MEDC_EXPORT med_int MEDnFamily23Attribute(const med_idt fid, const char *const meshname, const int famit)
Cette routine permet de lire le nombre d'attribut dans une famille dans un maillage créé avec MED 2....
Definition: MEDnFamily23Attribute.c:36
MED_CARTESIAN_GRID
Definition: med.h:139
SSCRUTE
#define SSCRUTE(chaine)
Definition: med_utils.h:323
med_mesh_type
med_mesh_type
Definition: med.h:133
MEDfamilyCr
MEDC_EXPORT med_err MEDfamilyCr(const med_idt fid, const char *const meshname, const char *const familyname, const med_int familynumber, const med_int ngroup, const char *const groupname)
Cette routine permet la création d'une famille portant sur les entités d'un maillage.
Definition: MEDfamilyCr.c:40
MEDmeshCr
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshCr(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int spacedim, const med_int meshdim, const med_mesh_type meshtype, const char *const description, const char *const dtunit, const med_sorting_type sortingtype, const med_axis_type axistype, const char *const axisname, const char *const axisunit)
Cette routine permet de créer un maillage dans un fichier.
Definition: MEDmeshCr.c:45
MED_CELL
Definition: med.h:145
MED_LNAME_SIZE
#define MED_LNAME_SIZE
Definition: med.h:85
MEDmeshEntityFamilyNumberRd
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshEntityFamilyNumberRd(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_entity_type entitype, const med_geometry_type geotype, med_int *const number)
Cette routine permet la lecture des numéros de famille d'un type d'entité d'un maillage.
Definition: MEDmeshEntityFamilyNumberRd.c:39
MED_NAME_SIZE
#define MED_NAME_SIZE
Definition: med.h:83
MEDmeshGridTypeRd
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshGridTypeRd(const med_idt fid, const char *const meshname, med_grid_type *const gridtype)
Cette routine permet de lire le type d'un maillage structuré (MED_STRUCTURED_MESH).
Definition: MEDmeshGridTypeRd.c:36
MEDnFamilyGroup
MEDC_EXPORT med_int MEDnFamilyGroup(const med_idt fid, const char *const meshname, const int famit)
Cette routine permet de lire le nombre de groupe dans une famille.
Definition: MEDnFamilyGroup.c:36
MED_CARTESIAN
Definition: med.h:260
med_utils.h
MED_NODE
Definition: med.h:145
MEDmeshEntityNameWr
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshEntityNameWr(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_entity_type entitype, const med_geometry_type geotype, const med_int nentity, const char *const name)
Cette routine permet d'écrire les noms d'un type d'entité d'un maillage.
Definition: MEDmeshEntityNameWr.c:39
med_axis_type
med_axis_type
Definition: med.h:260
MEDmeshGridTypeWr
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshGridTypeWr(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_grid_type gridtype)
Cette routine permet de définir le type d'un maillage structuré (MED_STRUCTURED_MESH).
Definition: MEDmeshGridTypeWr.c:37
med.h
MED_CONNECTIVITY
Definition: med.h:151
MED_NO_IT
#define MED_NO_IT
Definition: med.h:323
MEDfileCommentWr
MEDC_EXPORT med_err MEDfileCommentWr(const med_idt fid, const char *const comment)
Ecriture d'un descripteur dans un fichier MED.
Definition: MEDfileCommentWr.c:34
MEDmeshnAxis
MEDC_EXPORT med_int MEDmeshnAxis(const med_idt fid, const int meshit)
Cette routine permet de lire dans un maillage le nombre d'axes du repère des coordonnées des noeuds.
Definition: MEDmeshnAxis.c:35
MEDfileOpen
MEDC_EXPORT med_idt MEDfileOpen(const char *const filename, const med_access_mode accessmode)
Ouverture d'un fichier MED.
Definition: MEDfileOpen.c:42
MEDnFamily
MEDC_EXPORT med_int MEDnFamily(const med_idt fid, const char *const meshname)
Cette routine permet de lire le nombre de famille dans un maillage.
Definition: MEDnFamily.c:35
MEDmeshNodeCoordinateWr
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshNodeCoordinateWr(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_float dt, const med_switch_mode switchmode, const med_int nentity, const med_float *const coordinates)
Cette routine permet d'écrire dans un maillage le tableau des coordonnées des noeuds,...
Definition: MEDmeshNodeCoordinateWr.c:45
MEDmeshNodeCoordinateRd
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshNodeCoordinateRd(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_switch_mode switchmode, med_float *const coordinates)
Cette routine permet de lire dans un maillage le tableau des coordonnées des noeuds,...
Definition: MEDmeshNodeCoordinateRd.c:37
MED_ACC_CREAT
Definition: med.h:125
main
int main(int argc, char **argv)
Definition: 3.0.8/test10.c:50
MED_QUAD4
#define MED_QUAD4
Definition: med.h:206
MED_NO_NAME
#define MED_NO_NAME
Definition: med.h:270
MED_NODAL
Definition: med.h:257
MEDmeshElementConnectivityRd
MEDC_EXPORT med_err MEDmeshElementConnectivityRd(const med_idt fid, const char *const meshname, const med_int numdt, const med_int numit, const med_entity_type entitype, const med_geometry_type geotype, const med_connectivity_mode cmode, const med_switch_mode switchmode, med_int *const connectivity)
Cette routine permet de lire dans un maillage le tableau des connectivités pour un type géométrique d...
Definition: MEDmeshElementConnectivityRd.c:40